Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCN5AQ14524 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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