Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SPTAN1Q13813 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
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