Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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TUBB3Q13509 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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TUBB3Q13509 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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TUBB3Q13509 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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TUBB3Q13509 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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