Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP140Q13342 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SP140Q13342 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SP140Q13342 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP140Q13342 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP140Q13342 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP140Q13342 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP140Q13342 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP140Q13342 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP140Q13342 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP140Q13342 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP140Q13342 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP140Q13342 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP140Q13342 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SP140Q13342 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SP140Q13342 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP140Q13342 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP140Q13342 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP140Q13342 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP140Q13342 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.97
SP140Q13342 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
SP140Q13342 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
SP140Q13342 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SP140Q13342 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SP140Q13342 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SP140Q13342 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SP140Q13342 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SP140Q13342 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SP140Q13342 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SP140Q13342 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SP140Q13342 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SP140Q13342 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SP140Q13342 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SP140Q13342 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SP140Q13342 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SP140Q13342 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SP140Q13342 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SP140Q13342 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SP140Q13342 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SP140Q13342 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SP140Q13342 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SP140Q13342 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SP140Q13342 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SP140Q13342 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SP140Q13342 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SP140Q13342 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SP140Q13342 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SP140Q13342 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SP140Q13342 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SP140Q13342 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SP140Q13342 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SP140Q13342 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SP140Q13342 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SP140Q13342 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SP140Q13342 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SP140Q13342 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SP140Q13342 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SP140Q13342 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SP140Q13342 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SP140Q13342 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SP140Q13342 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SP140Q13342 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SP140Q13342 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms