Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RPA4Q13156 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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