Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GPS1Q13098 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms