Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CSTF3Q12996 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSTF3Q12996 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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