Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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GTF3C1Q12789 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
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