Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RBBP4Q09028 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RBBP4Q09028 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms