Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEC24CP53992 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEC24CP53992 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEC24CP53992 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEC24CP53992 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEC24CP53992 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SEC24CP53992 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEC24CP53992 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205 ms