Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPRDP23468 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
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