Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
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CLDN9O95484 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CLDN9O95484 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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CLDN9O95484 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
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CLDN9O95484 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
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CLDN9O95484 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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CLDN9O95484 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
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CLDN9O95484 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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CLDN9O95484 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CLDN9O95484 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CLDN9O95484 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
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