Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
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