Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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