Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TMOD3Q9NYL9 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TMOD3Q9NYL9 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
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