Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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ZBED3Q96IU2 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
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ZBED3Q96IU2 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
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ZBED3Q96IU2 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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ZBED3Q96IU2 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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ZBED3Q96IU2 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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ZBED3Q96IU2 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ZBED3Q96IU2 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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