Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC47Q96A33 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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