Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms