Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TMIEQ8NEW7 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TMIEQ8NEW7 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TMIEQ8NEW7 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TMIEQ8NEW7 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TMIEQ8NEW7 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms