Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.6 ms