Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC0.04□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IMPG1Q17R60 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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