Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDO1Q16878 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
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