Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNCBQ16143 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
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SNCBQ16143 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
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