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| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-159P-201 | ENST00000391080 | 106 nt | BASIC | 1.2 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | PIGP-205 | ENST00000399103 | 656 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.2 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR1253-201 | ENST00000408273 | 105 nt | BASIC | 1.2 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL161935.2-201 | ENST00000414627 | 60 nt | BASIC | 1.2 | □□□□□ -2.22 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | AC069257.2-201 | ENST00000441819 | 155 nt | BASIC | 1.2 | □□□□□ -2.22 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | AC091179.3-201 | ENST00000474761 | 144 nt | BASIC | 1.2 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC011352.1-201 | ENST00000512300 | 793 nt | BASIC | 1.2 | □□□□□ -2.22 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | AL606517.2-201 | ENST00000442855 | 241 nt | BASIC | 1.18 | □□□□□ -2.22 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | AC018638.8-201 | ENST00000588755 | 281 nt | BASIC | 1.18 | □□□□□ -2.22 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | Y_RNA.6-201 | ENST00000362350 | 114 nt | BASIC | 1.17 | □□□□□ -2.22 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | Y_RNA.473-201 | ENST00000384333 | 102 nt | BASIC | 1.17 | □□□□□ -2.22 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | MIR1185-2-201 | ENST00000408687 | 86 nt | BASIC | 1.17 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC008134.1-201 | ENST00000420943 | 193 nt | BASIC | 1.17 | □□□□□ -2.22 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-329P-201 | ENST00000459618 | 107 nt | BASIC | 1.17 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MTND5P5-201 | ENST00000503764 | 376 nt | BASIC | 1.17 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SRP72-202 | ENST00000504757 | 745 nt | TSL 2 BASIC | 1.17 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC103851.1-201 | ENST00000506833 | 274 nt | BASIC | 1.17 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU7-175P-201 | ENST00000515915 | 61 nt | BASIC | 1.17 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | CBX3P8-201 | ENST00000532412 | 525 nt | BASIC | 1.17 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC007450.1-201 | ENST00000536492 | 188 nt | TSL 3 BASIC | 1.17 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | 7SK.7-201 | ENST00000603504 | 247 nt | BASIC | 1.17 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MZT1P2-201 | ENST00000604387 | 248 nt | BASIC | 1.17 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL645939.4-201 | ENST00000604495 | 135 nt | BASIC | 1.17 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL355802.3-201 | ENST00000607571 | 545 nt | BASIC | 1.17 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SMAD5-AS1_4.1-201 | ENST00000615561 | 167 nt | BASIC | 1.17 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC007014.2-201 | ENST00000615581 | 479 nt | BASIC | 1.17 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | ZRANB2-AS2-222 | ENST00000625045 | 1014 nt | TSL 5 BASIC | 1.17 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | UBE3A-225 | ENST00000636667 | 5726 nt | TSL 5 BASIC | 1.17 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | JMJD1C-212 | ENST00000639129 | 7901 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 1.17 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | LINC00645-203 | ENST00000557399 | 3512 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.16 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-222P-201 | ENST00000362438 | 107 nt | BASIC | 1.16 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-280P-201 | ENST00000364145 | 104 nt | BASIC | 1.16 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNA5SP323-201 | ENST00000391094 | 133 nt | BASIC | 1.16 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR1285-1-201 | ENST00000408593 | 84 nt | BASIC | 1.16 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | COX6CP10-201 | ENST00000416832 | 224 nt | BASIC | 1.16 | □□□□□ -2.22 | | |