Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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