Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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