Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-1□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-1□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
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