Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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