Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPRIN1Q14444 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPRIN1Q14444 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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