Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CBFBQ13951 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CBFBQ13951 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CBFBQ13951 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CBFBQ13951 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CBFBQ13951 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CBFBQ13951 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CBFBQ13951 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CBFBQ13951 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CBFBQ13951 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CBFBQ13951 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CBFBQ13951 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CBFBQ13951 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CBFBQ13951 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CBFBQ13951 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CBFBQ13951 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CBFBQ13951 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CBFBQ13951 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CBFBQ13951 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CBFBQ13951 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CBFBQ13951 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms