Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.1 ms