Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HDAC1Q13547 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HDAC1Q13547 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HDAC1Q13547 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HDAC1Q13547 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HDAC1Q13547 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HDAC1Q13547 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms