Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PRPF4BQ13523 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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