Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC0.48□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
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