Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CBX3Q13185 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.8 ms