Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCAPQ12770 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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