Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.56□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
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HMGXB3Q12766 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
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