Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CPSF1Q10570 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC-0.61□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.63□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.64□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CPSF1Q10570 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC-0.66□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
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