Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.76□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.6 ms