Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r25W4VSP2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms