Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms