Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac6Q9Z2V5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac6Q9Z2V5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac6Q9Z2V5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac6Q9Z2V5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac6Q9Z2V5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac6Q9Z2V5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac6Q9Z2V5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac6Q9Z2V5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac6Q9Z2V5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac6Q9Z2V5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac6Q9Z2V5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac6Q9Z2V5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac6Q9Z2V5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac6Q9Z2V5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac6Q9Z2V5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac6Q9Z2V5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac6Q9Z2V5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac6Q9Z2V5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdac6Q9Z2V5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdac6Q9Z2V5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms