Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crlf3Q9Z2L7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms