Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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