Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms