Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Sh3bp5Q9Z131 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Sh3bp5Q9Z131 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Sh3bp5Q9Z131 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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Sh3bp5Q9Z131 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp5Q9Z131 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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Sh3bp5Q9Z131 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Sh3bp5Q9Z131 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp5Q9Z131 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Sh3bp5Q9Z131 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp5Q9Z131 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Sh3bp5Q9Z131 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp5Q9Z131 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Sh3bp5Q9Z131 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp5Q9Z131 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp5Q9Z131 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp5Q9Z131 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp5Q9Z131 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp5Q9Z131 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp5Q9Z131 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Sh3bp5Q9Z131 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp5Q9Z131 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp5Q9Z131 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp5Q9Z131 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp5Q9Z131 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp5Q9Z131 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp5Q9Z131 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp5Q9Z131 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp5Q9Z131 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp5Q9Z131 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp5Q9Z131 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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