Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L3

Oc90, Otoconin-90, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oc90Q9Z0L3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms