Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn3Q9Z0G9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 305.2 ms