Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp2Q9Z0E6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbp2Q9Z0E6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms