Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme3Q9WV85 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms