Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13bQ9WU72 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms